测序分析软件chromas v2.6.5 安装版
软件大小:3.1MB
软件语言:简体中文
用户评分:
软件类型:汉化软件
授权方式:免费版
下载官网:www.soft711.com
更新时间:2022-11-18
软件分类:理科软件
运行环境:/Win8/Win7/WinXP
chromas最新版软件能够方便地进行基因序列的查看以及分析,操作容易,支持多种格式的图谱文件,能够进行智能化的数据整理,帮助用户进行格式的转换,尤其适合医学行业的新手进行使用。DNA测序分析软件,使用这款软件可以方便用户对DNA的峰形图进行查看和编辑操作,软件支持ab1、scf以及ztr格式的图谱文件,并支持自动删除低质量序列(当质量数据可用时)或矢量序列,除此之外,软件还可以按照FASTA,FASTQ,EMBL,GenBank或GCG格式、文本格式来导出。
chromas最新版功能说明
将重叠序列组装一致,自动显示含糊不清的序列并编辑。
用高质量数据自动消除低质量序列并提高序列集合。
以应用生物系统、Staden色谱图(SCF)、MegaBace (esd)、FASTA、EMBL、GenBank、SwissProt,、GenPept、GCG RSF和纯文本格式打开和保存序列。
染色体图开放阅读框,借助G+C框架图,点击一下即可翻译ORFs。
查看检测基因型文件。
生成限制位点和片段图,并且列举切割、无切割和片段。
通过ClustalW的界面执行多序列。
打印色谱图,限制位点和片段图,并且打开阅读框架图。
执行核苷和蛋白质BLAST,通过NCBI网站搜索。
当编辑核苷酸系列时显示翻译。
执行反向翻译和标出核苷酸退化。
逆向&补充序列和色谱图。
通过准确匹配或最佳队列搜索序列。
复制色谱图截面的图形粘贴到文档或演示文件中。
划分蛋白质的亲水性和抗原性。
chromas最新版使用教程
1、选择File菜单打开一个序列文件,或者直接通过Open打开。
2、一般测序中一个反应大概能测的长度为800左右,由于荧光染料的干扰和机器性能,测序结果在最开始和最后面的时候有几十个碱基不准确,如下图中红框的部分。评判测序结果的时候可以忽略前50个和后50个碱基。
3、我们通过工具栏的缩放工具,可以放大或者缩小整个视图,可以看出,不同碱基对应不同的颜色。
4、通过工具栏的“Find'工具,可以查找某个序列。
5、通过“File”菜单栏的Blast Search可以直接连接在线数据库,将序列进行Blast,省去了我们打开NCBI等数据库然后复制序列再比对的麻烦。点击OK之后,然后点击“View report”即可。
6、Chromas还自带序列翻译蛋白质功能,点击“Options->Show Translations->All”显示三条蛋白质翻译序列。这里之所以显示三条,是因为Chromas不知道你的序列翻译的起始位点,所以如果你的序列是cDNA序列,那么这三条蛋白质序列中总有一条是你想要的,这在我们做蛋白质点突变的时候非常有用。当然如果你的是启动子等其他序列,这个功能是多余的。
7、我们可以将序列导出,并且可以设置导出的间隔、分行、以及是否显示序号。
8、当然可能会有同学想说,如果我想把测序峰图放在文章中,我该怎么弄Chromas没有存储为图片的选项,这时可能有同学就想用截图了,这里Chromas可以存储为PDF格式,在“File”里面选择Print 预览,然后选择PDF即可。
dna序列分析的基本原理
使用链终止剂,类似于正常dNTP的2,3-双脱氧核苷三磷酸(ddNTP),将延伸的DNA链特异性地终止。其反应体系也包括单链模板、引物、4种dNTP和DNA聚合酶。共分四组,每组按一定比例加入一种 (ddNTP),它能随机渗入合成的DNA链,一旦渗入合成即终止,于是各种不同大小片段的末端核苷酸必定为该种核苷酸,可以从放射自显影带上直接阅读DNA的核苷酸序列。
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